AI“撞”医药丨科创要闻

随着AI(人工智能)出现、发展,寻找基因图片、改变人类命运的齿轮也开始转动。

责任编辑:黄金萍

破解遗传密码、寻找基因突变,是人类理解生命的终极问题之一。

人类基因组拥有数以千计的基因,可能的基因突变更是达到百万级别。基因突变,因基因序列发生变化而改变遗传信息的过程,可能导致遗传疾病的发生、癌症的形成等变化。此前,测序技术、比较基因组学、PCR(聚合酶链式反应,放大扩增特定的DNA片段)技术等方法在寻找基因突变方面已经取得了很大的成功,但仍如同大海捞针。

随着AI(人工智能)出现、发展,寻找基因图片、改变人类命运的齿轮也开始转动。

9月19日,Google DeepMind在《科学》(Science)上发表题为Accurate proteome-wide missense variant effect prediction with AlphaMissense的文章,介绍了基于蛋白质结构预测工具AlphaFold2的最新AI工具AlphaMissense,用于预测全基因组错义突变的致病性。

错义突变(missense variant),指DNA中的碱基替换导致蛋白质内产生不同的氨基酸。在观察到的400多万个错义变异中,只有约2%在临床上被归类为致病性或良性,而其中绝大多数具有未知的临床意义。

而在上述论文中,AlphaMissense 能根据基因预测相关的蛋白质序列,通过对人类和灵长类变异种群频率数据库进行微调,以预测错义变异的致病性。研究人员共预测了19233种典型人类蛋白质中单氨基酸变化的致病性,从而推断出7100万个可能的错义突变;随后,对其中89%的错义变体进行分类,预测出57%可能是良性的、32%可能是病原性的。

AlphaFold让蛋白结构精确预测变得可能,AlphaMissence让错义突变的功能预测变得更加精准,这些预测可帮助临床医生对变异基因优先排序,诊断疾病。

AI在医药领域的应用如同流星雨般不断降落,带来了一个个惊喜。更令人振奋的是,这场“流星雨”才刚刚启幕。

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网络编辑:孙显安 校对:胡晓

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